미생물로 병을 고친다?… '마이크로바이옴' 치료제 뛰어드는 제약·바이오
유한·CJ·hy·지놈앤컴퍼니 등 관련 기업 직접 인수
2023년 시장 규모 151조원 예상
아직 상용화된 의약품 없어
美 세레스, 최근 3상 마치고 FDA 허가 신청
국내 고바이오랩·CJ·지놈앤컴퍼니 개발 경쟁
[아시아경제 이춘희 기자] 미생물으로 병을 고칠 수 있을까. 최근 국내 제약·바이오업계가 미생물로 병을 고치는 마이크로바이옴(microbiome) 시장을 미래 먹거리로 확보하기 위한 경쟁이 치열해지고 있다.
19일 업계에 따르면 최근 유한양행 유한양행 close 증권정보 000100 KOSPI 현재가 86,000 전일대비 3,400 등락률 -3.80% 거래량 378,828 전일가 89,400 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 유한양행, 렉라자 유럽 출시 마일스톤 3000만달러 수령 유한양행, 창립 100주년 기념 '백일장·사생대회' 16일 개최 유한양행 공식몰 '버들장터', 오픈 3주년 기념 고객 감사 프로모션 은 마이크로바이옴 치료제 기업 에이투젠을 인수했다. 화장품 기업 토니모리 토니모리 close 증권정보 214420 KOSPI 현재가 6,920 전일대비 320 등락률 -4.42% 거래량 190,190 전일가 7,240 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 [특징주]시진핑 방한 기대에 화장품주 강세…한국화장품 21%↑ [클릭 e종목]"토니모리, 실적 호조에 주가 급등…메가코스·뉴채널·신흥국 성장 견인" [클릭 e종목]“토니모리, 언젠가 증명될 오프라인의 힘” 의 자회사로 독자 개발 플랫폼을 바탕으로 대사성 질환, 면역 질환, 근육 질환 등 다양한 질병에 대한 마이크로바이옴 치료제를 개발해 온 기업이다.
유한양행은 기존 주식 인수를 통해 에이투젠의 1대 주주 지위를 우선 확보하고, 내년 초에 별도의 유상증자를 통해 추가 지분을 확보한다는 구상이다. 이를 통해 마이크로바이옴 기반 치료제 개발 및 기능성 프로바이오틱스 사업 확대에 나설 예정이다.
마이크로바이옴은 미생물(micro)과 생태계(biome)의 합성어다. 사람의 몸 속에 존재하는 수십조개의 미생물과 그 유전자를 뜻한다. 일반적으로 몸무게 70㎏ 성인 한 명이 약 38조개의 미생물을 갖고 있는 것으로 알려져 있다. 각자의 마이크로바이옴에 따라 건선, 역류성 식도염, 비만, 대장염, 심혈관계 질환 등 다양한 질환이 연관이 있다는 것으로 밝혀지면서 이를 통해 병을 낫게 한다는 새로운 접근법이 이뤄지고 있다.
과학기술정보통신부에 따르면 세계 마이크로바이옴시장 규모는 2020년 872억달러(약 121조5132억원)에서 내년 1087억달러(약 151조4735억원)에 이를 것으로 추산되는 등 새로운 모달리티(치료 접근법)으로 각광받고 있다.
이에 대기업 또는 제약·바이오기업들이 마이크로바이옴 관련 기업을 직접 인수해 산업에 진출하는 사례도 늘고 있다. 유한양행 외에도 CJ제일제당 CJ제일제당 close 증권정보 097950 KOSPI 현재가 228,500 전일대비 2,000 등락률 -0.87% 거래량 101,658 전일가 230,500 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 CJ제일제당, 바이오 저점 지났지만 해외 식품 '변수'[클릭 e종목] CJ제일제당, 1Q 매출 4조271억원…전년比 4.3% 증가 11번가 ‘그랜드십일절’ 연다…삼성·LG·CJ 등 140개 브랜드 참여 , hy, 지놈앤컴퍼니 지놈앤컴퍼니 close 증권정보 314130 KOSDAQ 현재가 6,630 전일대비 560 등락률 -7.79% 거래량 422,574 전일가 7,190 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 동구바이오제약, 지놈앤컴퍼니에 10억 추가 투자 지놈앤컴퍼니, 271억원 제3자배정 유상증자 결정 [특징주]고바이오랩, 美 특허 등록 소식에 급등 등 시장이 급성장하고 있다.
CJ제일제당은 지난해 천랩(현 CJ바이오사이언스)를 인수하며 CJ헬스케어(현 HK이노엔 HK이노엔 close 증권정보 195940 KOSDAQ 현재가 48,950 전일대비 1,650 등락률 -3.26% 거래량 269,369 전일가 50,600 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 HK이노엔 비원츠, 신제품 '펩타이드-X 쿨링 버블 마스크' 출시 HK이노엔 신약 '케이캡', 세계 최대 소화기학회서 美3상 결과 발표 HK이노엔·아토매트릭스, AI 기반 비만 신약 공동개발 ) 매각 이후 철수하는 듯 보였던 제약·바이오산업에 다시 진출했다. 2025년까지 후보물질 10건 보유, 기술수출 2건을 달성한다는 목표로 연구·개발(R&D)를 활발히 진행하고 있다.
마이크로바이옴 분야에서 상당한 기술력을 가진 것으로 평가받고 있는 HLB제넥스 HLB제넥스 close 증권정보 187420 KOSDAQ 현재가 2,395 전일대비 25 등락률 -1.03% 거래량 118,126 전일가 2,420 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 HLB제넥스, 1분기 매출 117억·영업이익 10억 기록…수익성 개선세 지속 지에프퍼멘텍, ‘신바이오베타 2026’서 고속 상업화 CDMO 플랫폼 공개 HLB제넥스, 김도연 대표 회사 주식 장내 매수…“책임경영 실천” 를 둘러싸고 인수설이 지속적으로 나오는 것도 이 같은 상황과 무관하지 않다는 평가다. 제노포커스는 한때 하림 하림 close 증권정보 136480 KOSDAQ 현재가 3,095 전일대비 65 등락률 -2.06% 거래량 820,428 전일가 3,160 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 홈플러스 급한불 끄나…하림그룹 홈플러스익스프레스 우선협상자로 [단독]10년간 과징금 달랑 '4건'… 담합의 유혹[설계자들]③ [요동치는 도심개발]①성수 HL그룹·양재 하림 부지 꿈틀…'땅주인 모시기' 전쟁 의 인수설이 나왔지만 이내 사실무근으로 드러났고, 현재는 롯데그룹을 비롯한 다양한 기업이 인수를 시도하고 있는 것으로 전해지고 있다.
지놈앤컴퍼니도 지난해 미국의 마이크로바이옴 위탁개발생산(CDMO) 기업 리스트랩을 인수해 마이크로바이옴 CDMO에 나섰다. 44년 역사의 마이크로바이옴 CDMO 기업으로 선진국 우수의약품제조및품질관리기준(cGMP)를 갖추고 다수의 마이크로바이옴 의약품 생산 이력을 갖췄다.
직접 인수는 아니지만 전문 기업들과의 연구·개발(R&D) 협력을 통해 마이크로바이옴 사업에 진출하는 기업들도 늘고 있다. 안국약품 안국약품 close 증권정보 001540 KOSDAQ 현재가 9,680 전일대비 520 등락률 -5.10% 거래량 2,497,654 전일가 10,200 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 안국약품, 미래에셋안국신성장투자조합1호 지분 130억원에 취득 바이오협회, 바이오 기업 후속 투자유치 위한 '스마트 스타트' 설명회 개최 제약 1세대 오너 모임 '팔진회', 48년 역사 피날레 은 지난 7일 마이크로바이옴 벤처 기업인 브이원바이오와 '원헬스 마이크로바이옴 기반 면역항암제 개발'을 위한 업무 협약을 맺었다. 안국약품의 면역항암제 연구개발 역량과 브이원바이오의 마이크로바이옴 연구플랫폼 기술의 강점을 결합해 면역항암제 개발에 나선다는 구상이다.
종근당바이오 종근당바이오 close 증권정보 063160 KOSPI 현재가 18,510 전일대비 290 등락률 -1.54% 거래량 20,548 전일가 18,800 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 종근당바이오 1분기 적자전환…매출·수익 동반 하락 종근당, ADC 항암 신약 美 글로벌 임상 첫 환자 등록 30조 넘은 아토피 치료제 시장, 차세대 기전 경쟁 가열 는 지난 7월 연세대 의료원 산학협력단과 마이크로바이옴 공동임상 연구센터 설립 및 마이크로바이옴 치료제 공동 연구개발 협약을 맺었다. 이를 통해 세브란스병원 내에 마이크로바이옴 공동 임상 연구센터를 마련하고, 염증성 장질환, 알츠하이머성 치매, 호흡기 감염질환 등 치료제 개발 수요가 높은 질환에 대한 마이크로바이옴 치료제 R&D에 나설 예정이다.
유산균 전문기업 hy(구 한국야쿠르트)도 마이크로바이옴 신약 개발 기업 이뮤노바이옴과 생균기반의약품(LBP) 공동 개발에 나섰다.
다만 아직 세계적으로 상용화된 마이크로바이옴 치료제가 나오진 않은 상태다. 가장 앞서 나가고 있는 미국 세레스 테라퓨틱스(Seres Therapeutics)가 개발 중인 클로스트리듐 디피실리 감염증(CDI) 치료제 후보 물질 'SER-109'의 임상 3상을 성공하면서 최초의 마이크로바이옴 신약이 나올 수 있을지 주목받고 있다. 세레스 테라퓨틱스는 지난 6월 FDA에 SER-109의 사용 승인을 신청한 상태다.
국내에서는 고바이오랩 고바이오랩 close 증권정보 348150 KOSDAQ 현재가 4,615 전일대비 95 등락률 -2.02% 거래량 164,496 전일가 4,710 2026.05.15 15:30 기준 관련기사 고바이오랩, 이사회와 전문경영인 중심의 경영 체제 개편 셀트리온, 고바이오랩과 장질환 치료제 후보물질 이전 계약 횡보장에도 '신바람'…비만치료株, 글로벌 활로에 '上' 이 가장 앞서가는 것으로 평가받고 있다. 건선 치료제로 개발 중인 'KBL697'은 임상 2상을 진행하고 있고, 동시에 궤양성대장염에 대한 2a상 임상시험계획(IND)도 FDA에 신청한 상태다.
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이외에도 지놈앤컴퍼니가 면역항암제로 개발한 'GEN-001'도 임상 2상이 진행 중으로 내년 중 2상 중간 결과가 나올 것으로 기대되고 있다. CJ바이오사이언스도 항암제 'CLCC1', 'CJRB-101' 등을 개발하고 있다.
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