먼저 해군관련 국방시스템공학과를 개설해 올해 정시에서 15명의 신입생을 선발한다. 국방시스템공학과에 입학한 학생들에게는 대학 재학 4년간의 등록금을 해군에서 전액 장학금으로 지급한다. 또 졸업 후 7년 간 해군 장교로 임관하게 되고, 복무기간동안 근무성적이 우수할 경우 장기 복무도 가능하다. 선발과정 1단계는 수능성적만으로 모집인원의 3배수를 뽑고, 2단계로 수능 80%와 체력검정 10%, 면접평가 10%를 반영한다. 신체검사, 인성검사, 신원조회는 합격ㆍ불합격 판정으로만 평가된다.
세종대는 육군과의 협의를 통해 정보보호학과를 신설하고 30명의 신입생을 모집할 계획도 추진하고 있다. 육군과의 협정 체결이 완료되면 세종대는 육ㆍ해ㆍ공을 아우르는 군사학부를 갖추게 된다.
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