结合单细胞与空间组学…从疾病预测到个性化治疗,生物学范式正迎来转变
将人类身体“复制”为数据的时代正逐步成为现实。通过读取每一个细胞的状态,并利用人工智能(AI)进行整合,从而预测疾病与免疫反应的“数字孪生”概念,正崛起为生物学领域新的研究潮流。
27日下午,在首尔站Biz Hub Center二层高端会议室举行的“科学记者协会-基础科学研究院(IBS)科学媒体学院”上,IBS病毒研究团CI(研究团团长)兼韩国科学技术院(KAIST)医学科学研究生院教授Park Jongeun,以“通过细胞图谱和人工智能揭示人体与疾病之谜”为题进行了演讲。
Park Jongeun兼任IBS病毒研究团CI(研究团团长)及韩国科学技术院(KAIST)医学科学研究生院教授,正在“科学记者协会-基础科学研究院(IBS)科学媒体学院”上就“以细胞图谱和人工智能揭示人体与疾病之谜”进行演讲。Kim Jonghwa 记者供图
View original imagePark Jongeun CI介绍了将单细胞分析、空间组学与人工智能(AI)相结合,把人类生物学重构为“可模拟系统”的研究方向。他表示:“如今人类细胞图谱几乎已经进入完成阶段”,“下一步必须理解在对细胞施加刺激时细胞如何做出反应,只有这样才能真正解释生命现象。”
从癌症到免疫、疫苗……向数据驱动的“预测研究”拓展
这种研究路径正在实际研究现场不断拓展应用范围。具有代表性的是,以血液中的细胞构成为基础、区分疾病状态的“血液表型(Blood Phenotype)”研究正在开展,通过这一方式,研究人员尝试对自身免疫性疾病、感染性疾病等多种疾病进行分类,并预测药物反应性。
Park CI说明:“如果基于患者的细胞状态进行事前分型,再与药物反应性相连接,就可以预测治疗效果”,“在精准医疗领域,这种研究路径已经得到应用。”
此外,通过单细胞分析,研究人员已经确认信使核糖核酸(mRNA)疫苗会选择性作用于特定细胞并诱导免疫反应,揭示疫苗在细胞层面的作用原理等研究也在推进之中。
不过,这一技术尚未发展到可以完全取代传统实验的阶段。他表示:“目前的模型在理解细胞层面方面具备优势,但涉及多种组织同时相互作用的整体生命体系统,仍然需要动物实验”,“距离实现完全替代至少还需要5至10年以上。”
这一最新研究趋势也被视为展现生物学研究范式转变的案例。以往的生物学主要聚焦于对单个现象的观察与分析,而近年来,基于大规模数据,试图整体理解细胞间相互作用与疾病进程的研究尝试正在不断扩大。
Park CI表示:“关键在于通过数据构建并验证假设”,“随着数据不断积累,人类理解和预测疾病的方式也将日益精细化。”
他补充称:“数字孪生虽然涵盖多种概念,但归根结底,是试图定量理解细胞与基因之间的关系”,“通过这类模型,正在为更系统地阐释人类生物学奠定基础。”
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