UNIST与以色列魏茨曼研究所揭示酶的机械运作原理

“粘弹性”降低会削弱酶的化学活性,刊登于《Nature Physics》

已经证实,调节我们体内生化反应的酶,其实际运作方式就像由基因设计出的纳米机器。


这一研究结果于当地时间28日发表在物理学最高权威期刊《自然·物理学》(Nature Physics)上。


蔚山科学技术院(UNIST)物理学系Tsvi Tlusty特聘教授团队通过实验揭示,酶内部的黏弹性在酶的生物学功能中起决定性作用。

UNIST 特聘教授 Cvi Tlusty。UNIST 提供

UNIST 特聘教授 Cvi Tlusty。UNIST 提供

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酶是一类生物蛋白质,它能激活消化食物、产生能量、复制DNA以及处理代谢废物等化学过程。


研究结果显示,一旦这种酶的机械特性——黏弹性遭到破坏,酶的化学功能——活性就会大幅下降。就像机械中类似减震器的缓冲装置损坏后整机会发生故障一样,当酶中如同弹簧般、即时且柔性的恢复力——黏弹性被破坏时,酶也会丧失原本功能。


研究团队利用先进测量技术,在酶中找出了发挥类似机械减震器作用的高应变(high strain)区域,并通过将该区域中的1个氨基酸替换、制造突变体的实验,证实了这一事实。

实验性揭示起到机械关节作用的高变形区域的分析方法。以色列魏茨曼科学研究所提供

实验性揭示起到机械关节作用的高变形区域的分析方法。以色列魏茨曼科学研究所提供

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实验结果表明,即便只改变1个氨基酸的突变,也会使酶的活性降低50%以上。实验中使用的鸟苷酸激酶由总计207个氨基酸构成。


在预测突变引起的酶三维结构变化时,研究团队使用了蛋白质结构预测人工智能AlphaFold。分析发现,实际结构变化越大,酶活性下降得越多。这一结果支持了这样一个结论:酶结构的机械性能与其生化功能被精密地联结在一起。


主导该研究的Tsvi Tlusty教授表示:“我们现在应当把酶视为由基因精密设计的软性纳米机器,而不仅仅是简单的化学反应工具”,“本研究表明,机械特性是推动生命精密性与高效率得以实现的进化原动力。”


本次研究与以色列魏茨曼科学研究院(Weizmann Institute of Science)的Elisha Moses博士团队合作完成。


研究工作在科学技术信息通信部韩国研究财团、基础科学研究院(IBS)以及以色列科学基金会(Israel Science Foundation)的资助下开展。





本报道由人工智能(AI)翻译技术生成。

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